最早的菌群与疾病的研究，首先是肥胖。美国科学家JefferyGordon从年开始发表菌群与肥胖关系的文章，他发现胖人和瘦人的肠道菌群的功能和结构不一样，并且他把胖人与瘦人的菌群，通过粪便移植的办法，移植给无菌动物。
所谓无菌动物是养在一个特殊的隔离器里面，整个环境都是无菌，它浑身上下都是无菌，我们把人的菌群移植到无菌小鼠，移植到胖人的菌群小鼠，它的脂肪积累就会增减；而移植瘦人菌群的小鼠就没有出现这样的情况。
上海交大赵立平教授在年的一篇学术报告表明：他们研究一个样本，在23周内减重51.4公斤，在这个人体内发现了阴沟肠杆菌B29，并占到肠道菌群总量的35%，通过菌群干预4周后消灭了这种菌，就成功减重了该患者，而且该患者的糖尿病、高血脂、高血压全都回复了正常水平。
如何用益生菌控制肥胖？
在加拿大进行的鼠李糖乳杆菌饮食干预的临床试验中，肥胖志愿者在前12周接受限制卡路里饮食，后12周维持体重。前12周志愿者体重减轻明显高于安慰剂组，后12周志愿者女性体重减轻继续下降，但安慰剂组没有出现体重下降的趋势。对男性受试者的研究结果表明，鼠李糖乳杆菌对肥胖女性有减肥作用。一些研究还发现，LGG菌株用脂肪饮食治疗的小鼠体重增加减少，胰岛素敏感性增加。LGG显著降低了肝脏附睾脂肪和肥胖相关的生物标志物。
益生菌通过调节肠道菌群的变化对人体健康产生有益的影响，肠道微生物通过发酵分泌生物活性物质，在肠黏膜中引起多种反应，影响肝脏和脂肪组织的细胞代谢，从而调节体内脂、糖的平衡。
肠道菌群可以调节肠道屏障和内分泌功能，影响营养物质的运输和吸收。因此，调节肠道菌群是改善和管理肥胖的有效策略。
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