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知耕快报利用碱基编辑器获无转基因柑橘 [复制链接]

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『知耕?WeeklyCheck』

『知耕.快报』知耕定期准时摘取农业科技领域重要的、有价值的产品技术动态及新闻资讯,可能改变这个行业的信息都在其列。

快报摘要-WrapUp

科|技|突|破

ScienceBreakthrough

Nature:利用腺嘌呤\胞嘧啶碱基编辑器获得无转基因柑橘

基因编辑

Science:利用CO2通过化学-酶级联转换成功合成淀粉

合成生物

NaturePlants:通过遮荫条件下减缓Rubisco的失活速率提高作物生产力

作物生产

GenomeBiololgy:利用碱基编辑器实现环形RNA敲除新方法

基因编辑

FASEBJournal:通过激活抗氧化系统和mtUPR抑制阿尔兹海默症

功能性成分

MetabolicEngineering:利用组合途径工程策略改造枯草芽孢杆菌从头合成几丁质寡糖

合成生物

NatureCommunications:应用AlphaFold2进行多肽-蛋白质对接

AI设计

NatureCommunications:通过抗氧化剂和赤霉素缓解自身免疫病柑橘*龙病

植物免疫

NucleicAcidsResearch:RNA跟踪平台Cas6FC

RNA检测

HorticultureResearch:枣树“癌症”发生关键效应因子

植物病原体

大|企|业|动|向

BigPlayer

百合股份登陆上交所主板

隆平高科增持杭州瑞丰

渼颜空间与蓝晶微生物合资共同开发PHA材料

CurioGenomics和DaicelArborBiosciences推出生物信息学平台myCurio?

Biotalys利用生物防治产品Evoca实现%产量增长

Symborg收购GlenBiotech巩固农业生物技术领域的国际领先地位

先正达作物保护公司收购Bionema两种生物杀虫剂

融|资|速|递

FundsFunding

小藻科技斩获2亿融资

碳中和合成生物智造企业酶赛生物完成近3亿元C轮融资

DNA数据存储技术公司密码子获数千万Pre-A轮融资

RedefineMeat获1.35亿美元新投资

IntegriCultureInc筹集万美元建设细胞农业设施平台

BotanicalSolutionInc.获万美元A轮融资

农业科技初创公司Greenlabs获1.4亿美元C轮融资

CommunityVoice

农业用基因编辑植物安全评价指南(试行)发布

农业农村部修改《农业转基因生物安全评价管理办法》等规章

农林领域23家入选国家工程研究中心新序列名单

农业农村部基因编辑创新利用重点实验室正式成立

英国将为植物基因编辑制定新立法

多组学数据资源体系建设取得系列进展

01科|技|突|破

Nature:利用腺嘌呤\胞嘧啶碱基编辑器获得无转基因柑橘

基因编辑

碱基编辑器在不产生双链断裂的情况下,为精确的基因组编辑提供了选择,从而避免了基因组不稳定和DNA修复导致的不可预测结果的风险。碱基编辑器介导的柑橘精确基因编辑尚未见报道。近期,佛罗里达大学汪念博士团队成功地利用腺嘌呤碱基编辑器编辑了甜橙口腔溃疡易感基因LOB1的启动子区TATAbox,同时团队还成功地编辑了柑橘中的乙酰乳酸合酶基因。该研究成功将碱基编辑器用于精确的柑橘基因编辑。胞嘧啶碱基编辑器已被用于通过瞬时表达生成无转基因柑橘。

Science:利用CO2通过化学-酶级联转换成功合成淀粉

合成生物

在过去的几十年里,人们在二氧化碳(CO2)捕获和利用方面做出了巨大的努力,但是通过生物技术大规模利用CO2还缺乏市场竞争力,迫切需要新的方案和技术。近期,中科院天津工业生物技术研究所在体外利用CO2通过化学-酶级联转换的方式成功合成了淀粉,其效率在特定的条件下可以达到植物天然合成淀粉的8.5倍。这一开创性的工作为未来实现无土化的粮食生产提供了理论上的依据,具有重要的学术价值和潜在的巨大社会意义。

NaturePlants:通过遮荫条件下减缓Rubisco的失活速率提高作物生产力

作物生产

光合作用是植物碳同化及产量形成的决定性因素。过去对光合作用的研究重点一直放在如何提高稳态最大光合速率上,但是有研究表明田间作物冠层光合对持续光照变化的适应速率才是促进作物生产力的关键,并且通过转基因手段提高烟草对光暗转换的适应速率可显著提高作物生产力。近日,英国LancasterUniversity团队于NaturePlants发表研究。该研究通过不同评估方法研究了光暗交替下的Rubisco酶活性变化,揭示了过去研究中对遮荫条件下Rubisco失活速率的低估,并表明Rubisco失活速率调整在未来作物生产力提升中的关键作用。

GenomeBiololgy:利用碱基编辑器实现环形RNA敲除新方法

基因编辑

前体RNA可以同线性mRNA一样通过反向剪接产生环形RNA,其在不同物种中均有广泛表达。但是由于环形RNA与其同源线性mRNA在一级序列上的一致性,对环形RNA进行敲低和敲除操作比较困难,这也限制了对环形RNA生成加工和功能作用的研究。年1月10日,中科院上海营养与健康研究所杨力研究组在GenomeBiology发表文章,报道了利用碱基编辑器实现环形RNA在基因组水平敲除的新策略。研究结果不仅首次在基因组水平证实了环形RNA及其同源线性RNA在共用剪接位点的竞争,也建立了利用碱基编辑器对环形RNA进行基因组敲除的新方法。最后,研究人员也对利用不同策略(包括Cas9敲除、Cas13敲低和BE敲除)开展环形RNA功能探索的优劣势进行了探讨,期望为后续的研究提供有益的参考和建议。

FASEBJournal:通过激活抗氧化系统和mtUPR抑制阿尔兹海默症

功能性成分

枸杞是我国传统名贵中药,被誉为“长寿果”。阿尔兹海默症(AD)是一种常见的老年神经退行性疾病。Aβ在脑内的生成和聚集被认为是AD的触发机制。因此,研究AD患者中*性Aβ的产生和清除是治疗AD的有效途径。年1月19日,中科院生物物理研究所陈畅课题组利用AD转基因线虫模型,发现枸杞水提物通过激活抗氧化系统和线粒体未折叠蛋白反应(mtUPR)抑制阿尔兹海默症的发展。该研究发表于FASEBJournal。这项研究首次发现LBE通过激活线粒体UPR对AD模型线虫发挥保护作用,为揭示枸杞预防和治疗AD的重要功效提供了新的机制。

MetabolicEngineering:利用组合途径工程策略改造枯草芽孢杆菌从头合成几丁质寡糖

合成生物

几丁质和壳聚糖具有广泛的生物活性,但由于难溶于水,应用受到限制;其寡聚物甲壳低聚糖(COSs)则易溶于水,可被广泛应用于医药、食品和农业等领域,其中COSs可被划分为壳寡糖(CSOSs)和几丁质寡糖(CTOSs)。近日,MetabolicEngineering在线发表了江南大学食品合成生物学与生物制造团队的研究成果,团队利用组合途径工程实现了CTOSs在枯草芽孢杆菌中的从头合成。该研究证明了通过合成生物学从头合成结构明确的CTOSs的可行性,为进一步工程改造以实现其商业化生产奠定了良好的基础。

NatureCommunications:应用AlphaFold2进行多肽-蛋白质对接

AI设计

多肽-蛋白质相互作用对许多生物过程十分重要,多肽常通过结合蛋白质和介导或阻断相互作用,作为治疗药物应用于生物技术、药物传递、成像等。近日,NatureCommunications发表了一篇研究,在不需要多肽的多序列比对信息的情况下,作者应用AlphaFold2成功建模出多肽-蛋白质复合体,并且还可以处理配体结合诱导的受体构象变化。研究证明AlphaFold2除了能够进行结构预测之外,还可以快速准确地模拟多肽-蛋白质相互作用。

NatureCommunications:通过抗氧化剂和赤霉素缓解自身免疫病柑橘*龙病

植物免疫

柑橘*龙病HLB号称“柑橘艾滋”,是由一种限于韧皮部内寄生的革兰氏阴性细菌-韧皮部杆菌(Clas)引起,能够侵染多种芸香科植物。年1月26日,NatureCommunications杂志在线长文发表了美国佛罗里达大学NianWang课题组的研究。课题组首次证实柑橘*龙病是一种病原体触发的免疫疾病,可通过抗氧化剂和赤霉素缓解。这是柑橘*龙病发病机制的重大进展。

NucleicAcidsResearch:RNA跟踪平台Cas6FC

RNA检测

活细胞RNA追踪中荧光蛋白标记的Cas9和Cas13创新应用推动RNA生物学研究。但是Cas9/Cas13平台以及广泛使用的MS2-MCP技术未能解决高背景噪声的问题。最近有报道称CRISPR/Cas6在与RNA上的Cas6结合位点(CBS)相互作用后会表现出构象改变。年1月21日,河北科技大学韩春雨团队研究利用这一特性设计了一个基于Cas6的开关平台,用于在体内检测目标RNA。将split-Venus片段与内切核糖核酸酶突变的大肠杆菌Cas6(dEcCas6)的两端结合,允许配体(CBS)激活split-Venus互补。研究发表于NucleicAcidsResearch(IF=17)。该研究开发了一种新的RNA跟踪平台——基于Cas6的荧光互补(Cas6FC),其固有地具有高灵敏度和特异性。

HorticultureResearch:枣树“癌症”发生关键效应因子

植物病原体

枣是鼠李科植物中经济价值最高的树种。枣疯病是一种由枣疯病植原体引起的致死性病害,被称作枣树“癌症”。严重影响枣树叶片、花和果实等器官的生长发育,诱导枣树丛枝、小叶及败育等症状,是危害我国枣生产的最重要病害之一。近日,HorticultureResearch在线发表了河南农业大学园艺学院的研究论文。该研究作者首先依据枣疯病植原体基因组鉴定出8个枣疯病植原体候选效应因子并命名为Zaofeng1-Zaofeng8。将它们分别转化至拟南芥中后发现Zaofeng6过表达拟南芥株系表现出从枝及矮化等表型。此外,Zaofeng6的瞬时表达可诱导烟草叶片出现明显的过敏性坏死反应。结果表明Zaofeng6是枣疯病植原体致病效应因子。同时研究结果阐明了植原体侵染枣后丛枝小叶的发生机制,为全面了解病原与寄主互作关系、枣疯病发生机制和开展枣抗病育种提供重要的理论基础。

02大|企|业|动|向

百合股份登陆上交所主板

年1月25日,威海百合生物技术股份有限公司登陆上交所主板。本次公开发行股票为1,万股,发行股数占发行后总股本比例为25%。百合股份是一家专业从事营养保健食品的研发、生产和销售的国家高新技术企业。公司历经多年的研发与积累,已形成软胶囊、硬胶囊、片剂、粉剂、口服液、滴剂、瓶装饮品及袋装饮品等多剂型、规模化生产能力,同时建立了高效的研发管理及供应链管理体系,能为国内外客户提供涵盖产品定位、配方研究、生产审批及成品生产等全流程服务。

隆平高科增持杭州瑞丰

1月24日,隆平高科公告其参股公司杭州瑞丰拟进行部分股权转让及增资扩股引入优势战略性投资者。其中,隆平高科通过股权交易拟受让诚通中信农业结构调整投资基金(简称“中信农业基金”)持有的4.1%的杭州瑞丰股权,持股比例由22.97%变更为23.20%;中央企业乡村产业投资基金股份有限公司(简称“央企基金”)通过股转交易及增资交易战略投资杭州瑞丰,合计持股比例为20.00%。杭州瑞丰是一家专注于玉米、大豆等农作物生物技术产品研发的科技型企业,转基因产品线丰富,研发后劲足。隆平高科是国内种业龙头,国内玉米种子市场占有率行业第一,公司高度重视生物育种领域的布局。央企基金隶属于国投集团旗下国投创益产业基金管理有限公司。

渼颜空间与蓝晶微生物合资共同开发PHA材料

PHA是一种存在于微生物胞内的天然聚酯,具有特殊的生物可降解性、气体相隔性、生物组织相容性、抗凝血性、疏水性、光学异构性等特点,在作为高端的生物医用材料应用于医疗设备、组织工程和药物载体等领域。年1月19日,四环医药集团旗下北京渼颜空间科技有限公司(渼颜空间)与北京蓝晶微生物科技有限公司(蓝晶微生物)签署协定成立合资公司,共同开发包括PHA微球及基于生物制造的再生医学材料,双方将共同完成产品的研发、合规化申报及后续商业化推广。蓝晶微生物是一家基于合成生物技术从事分子与材料创新的企业,致力于设计、开发、制造和销售新型生物基分子和材料,年1月完成累计人民币15亿元B系列融资。四环医药是一家拥有独立领先的自主生产、研发技术平台,具备丰富的全球化产品管线和成熟卓越销售体系的国际化制药及医美企业。

CurioGenomics和DaicelArborBiosciences推出生物信息学平台myCurio?

近日,CurioGenomics和DaicelArborBiosciences宣布推出基于云的生物信息学平台myCurio?,这得益于他们多年的产品开发和营销合作伙伴关系。myCurio与Arbor行业认可的myBaits?和myReads?定制NGS产品和服务的集成提供了独特而强大的生物信息学功能,使研究人员能够更快地针对他们的数据提出更多更好的问题。两家公司还宣布计划在明年为其集成产品提供新功能。首先是DaicelArborBiosciences的新小麦促进剂目标捕获面板的发布。

Biotalys利用生物防治产品Evoca实现%产量增长

化学农药会污染农田并对有益昆虫、土壤微生物等造成危害。近日,农业技术公司Biotalys宣布在生物防治产品Evoca的生物活性成分表达方面取得了突破。Evoca是Biotalys管道中第一个基于蛋白质的生物防治产品,旨在帮助种植者在综合害虫管理计划中保护草莓、葡萄和其他高价值水果和蔬菜等作物免受疾病侵害。Biotalys成立于年,是从VIB(法兰德斯生物技术研究所)分拆出来,该公司通过专有的基于蛋白质的生物防治技术来保护农作物,旨在替代传统化学农药,以实现可持续和更安全的食品供应。

Symborg收购GlenBiotech巩固农业生物技术领域的国际领先地位

生物技术公司Symborg宣布收购阿利坎特大学的初创公司GlenBiotech,为农业提供生物控制解决方案。通过这笔交易,Symborg正在加强其产品组合,以及在迈向更可持续农业模式的运动中的领导地位。Symborg使用GlenBiotech的技术,该技术以真菌白僵菌为中心,开发新产品,为农民提供控制害虫的生物机制,符合欧盟从农场到餐桌的战略。

先正达作物保护公司收购Bionema两种生物杀虫剂

SyngentaCropProtection已经收购了英国生物防治技术开发商Bionema两种下一代生物杀虫剂NemaTrident?和UniSpore?,以对抗园艺和观赏植物、草坪设施和林业中不断增加的抗药性和范围广泛的昆虫和害虫,为客户提供更多选择。这是先正达专业解决方案公司在构建世界领先的生物制剂产品组合方面迈出的重要一步,并为扩大作物保护生物防治解决方案提供了机会。UniSpore?是一种基于天然微生物(昆虫病原真菌)的创新产品。NemaTrident?是一种获得专利的昆虫病原线虫解决方案。

03融|资|速|递

小藻科技斩获2亿融资

微藻广泛分布在海洋、土壤、淡水之中,可以通过它高效的光合作用和便于合成生物活性物质的两大特征,广泛应用于新能源开发、医疗保健、食品加工、水产养殖和化妆品等多个领域。近期,专注于微藻培育技术和下游产品提炼应用的企业-小藻科技已完成了两轮融资,融资总额已超过2亿人民币,同时公司正在准备B+轮融资,融资目标1.5亿元。小藻科技是一家以微藻培育技术和下游产品提炼应用为核心,集研发、生产、销售、服务于一体的高新生物技术企业,它不仅拥有国内最大的微藻生产基地,也是全球首家实现微藻EPA工业化规模生产的企业。从藻种选育,室内培养,室外培养到下游收集,加工和提纯,小藻科技全部拥有自主知识产权。

碳中和合成生物智造企业酶赛生物完成近3亿元C轮融资

合成生物学被认为是现代科学最富前景的领域之一,全球众多技术预测机构都将其发展及由合成生物学对全球经济产生的影响提升到国家战略高度。近期,国内领先的碳中和合成生物智造企业宁波酶赛生物工程有限公司(以下简称“酶赛生物”)宣布完成近3亿元人民币C轮系列融资。其中,C2轮领投机构为元生创投,C1轮由康君资本独家战略投资,建发新兴投资、普华资本、翰森投资、康鹏钮特和探针新医疗基金均参与了本轮投资。同期酶赛生物完成对旻和医药的收购,产能得到极大提升。探针资本持续担任独家财务顾问。酶赛生物围绕蛋白质工程(酶的定向进化技术)和代谢类多酶串联工程,搭建了自己的合成生物学平台,用以满足在医药中间体、精细化工、食品保健品、材料、医美等多个领域均有不断增长的需求。

DNA数据存储技术公司密码子获数千万Pre-A轮融资

聚焦DNA数据存储技术开发的「密码子」已于近日完成数千万元Pre-A轮融资。本轮融资由凯泰资本和磐霖资本联合领投,王道资本和中关村创业大街资本跟投。此前获奇绩创坛天使轮投资。密码子成立于年,是国内第一家专注于DNA数据存储技术开发的初创公司。密码子团队基于对合成生物学与数据存储的深入理解,挖掘信息技术与合成生物学底层逻辑的交叉点,开创性地开发了新型的DNA数据存储技术。通过特有的编码算法将各种类型的数据「包括文字、图片、声音等」转化为DNA序列,并进行存储与读取。

RedefineMeat获1.35亿美元新投资

以色列3D打印植物肉公司RedefineMeat已经获得了1.35亿美元的新投资,用于资助在以色列和荷兰的生产线,以及扩大与全球餐馆和食堂的合作。这笔新的投资使RedefineMeat公司迄今筹集的资金总额达到约1.8亿美元。该轮融资由风险投资基金HanacoVentures领投,该基金最近还投资了以色列的无动物奶和乳制品开发商Remilk,以及专注于食品科技的英国基金SynthesisCapital。其专利的工业级数字制造技术能够完全复制牛肉的肌肉结构。据这家初创公司称,这些产品由豌豆蛋白、大豆、甜菜根、鹰嘴豆和椰子脂肪混合制成,蛋白质含量高,没有胆固醇,而且外观、烹饪、感觉和味道都和真实的一样。

IntegriCultureInc筹集万美元建设细胞农业设施平台

年1月24日,日本食品科技公司IntegriCultureInc宣布在A轮融资中从12位投资者中筹集万美元建立一个普遍可用的细胞农业平台。迄今为止,公司已经筹集了约万美元。IntegriCultureInc.计划利用筹集到的资金建立一个细胞农业基础设施平台,供各种规模和部门的机构使用。该公司的目标是在年推出世界上第一个商业化的细胞培养的鹅肝。

BotanicalSolutionInc.获万美元A轮融资

BotanicalSolutionInc.(BSI)是用于农业和制药应用的可持续、一致和具有成本效益的先进植物材料的创新者,已在帕洛阿尔托风险投资公司OtterCapital牵头的A轮融资中成功完成万美元。本轮融资将通过促进其当前基于植物的产品的地域扩张和开发源自其专有生物技术平台的新产品管道来增强BSI的价值主张。对于农业市场,本轮A轮融资将支持BSI的首个商业成功产品BotriStop?及其最近宣布的全球品牌Quillibrium?的生产和销售增长,它们基于原产于智利的一种组织培养的树,即Quillajasaponaria。该产品已成功用于智利各地的各种水果和蔬菜。

农业科技初创公司Greenlabs获1.4亿美元C轮融资

Born2GlobalCentre初创成员Greenlabs宣布已在C轮融资中筹集了1.4亿美元,以加速其全球扩张。BRVCapitalManagement,SkylakeIncuvestCo.和SKSquare三位机构参与了最新轮投资。这项投资使筹集的资金总额超过1.76亿美元。Greenlabs成立于年,是韩国领先的AgTech公司,已将从生产到分销的完整农业产业价值链数字化。以可持续创新食品供应链为使命,Greenlabs使农业生产商能够更好地控制其新鲜农产品,同时为其企业客户提供可靠的采购渠道。其服务产品包括“FarmMorning”应用程序,这是一个面向农产品种植者的智能农场系统以及面向生鲜企业采购商的“新阳市场”。

04产|业|之|声

农业用基因编辑植物安全评价指南(试行)发布

基因编辑被认为是最具应用前景的生物育种技术,已在抗病虫害、品质提升、抗逆、增产等方面发挥巨大作用。目前没有国际公认的基因编辑植物监管框架,每个国家对基因编辑植物的监管*策制定方案也不同,大多倾向于采取产品导向监管*策。1月24日,为规范农业用基因编辑植物安全评价工作,根据《农业转基因生物安全管理条例》和《农业转基因生物安全评价管理办法》,农业农村部正式印发了《农业用基因编辑植物安全评价指南(试行)》,标志着我国基因编辑植物安全评价监管*策大大简化,有望进一步加快我国生物育种产业化进程。

农业农村部修改《农业转基因生物安全评价管理办法》等规章

为有序推进生物育种产业化应用,发展现代种业,保障粮食安全,农业农村部决定对《农业转基因生物安全评价管理办法》《主要农作物品种审定办法》《农作物种子生产经营许可管理办法》《农业植物品种命名规定》4部规章的部分条款予以修改。本决定自公布之日起施行。农业部年9月18日公布、农业农村部年4月25日修订的《转基因棉花种子生产经营许可规定》同时废止。

农林领域23家入选国家工程研究中心新序列名单

近日,国家发展和改革委员会办公厅发布第二批纳入新序列管理的国家工程研究中心名单。至此,全国共有家国家工程研究中心纳入新序列名单,包括23家农林领域国家工程研究中心,占总数的12.6%。其中,高校、科研院所和企业牵头建设的农林领域国家工程研究中心分别有9家、13家和2家。标志着国家工程研究中心和国家工程实验室优化整合工作顺利完成。

农业农村部基因编辑创新利用重点实验室正式成立

1月21日,中国农业大学在学校国际会议中心举行农业农村部基因编辑创新利用重点实验室(以下简称“实验室”)成立大会,这也是全国农学领域目前唯一的基因编辑部级重点实验室。基因编辑创新利用重点实验室聚焦基因编辑关键核心技术,围绕具有自主知识产权的新底盘核酸酶发掘、外延新技术研发和重大应用价值的新种质和新品种培育开展研发工作,服务国家种业振兴。为加强基因编辑研究工作,学校成立了涵盖作物、动物、园艺、草业和微生物等方向多人的基因编辑核心技术攻关队伍,开展协同攻关。

英国将为植物基因编辑制定新立法

基因编辑不同于基因改造,因为它允许在没有来自其他物种DNA的情况下产生有益的特征,该技术使育种者和科学家能够遵循模仿自然育种的过程。英国由于退出欧盟,将制定新的立法,以减少不必要的基因编辑繁文缛节,同时科学家将能更轻松地使用基因编辑等技术进行植物研究和开发,帮助农民种植更具抗性、营养和高产的作物。利用大自然通过遗传技术提供的遗传资源,将为农民创造新的机会来种植更具复原力的作物。这将支持开发创新的方法来保护环境,例如显着减少或消除杀虫剂和除草剂的使用——保护传粉媒介。另一个潜在的好处包括使作物更能抵抗恶劣的天气和气候变化。

多组学数据资源体系建设取得系列进展

在《核酸研究》(NucleicAcidsResearch)出版的年度数据库专刊上,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心(CNCB-NGDC)共有10篇论文集中发布,展示了国家生物信息中心多组学数据资源体系建设的最新成果。年,国家基因组科学数据中心与共建单位及30多家合作单位密切协同,进一步更新和完善核心数据库资源(BioProject、BioSample、GSA、GWH、GVM、GEN、MethBank、非编码RNA、新冠病*资源信息库、生物多样性等),同时开发出脑疾病知识库BrainBase、癌症单细胞表达谱数据库CancerSCEM、细胞药物反应知识库CeDRAtlas、细胞分类库CellTaxonomy、分子序列组分数据库CompoDynamics、表观基因组关联分析平台EWASOpenPlatform、再生知识库RegenerationRoadmap、单细胞甲基化库scMethBank、生命科学文献库OpenLB等,涉及单细胞组学和精准医学研究等多个前沿领域,建成涵盖国家人类遗传资源、重要战略生物资源、在线分析工具等在内的多组学数据资源体系,形成组学“数据—信息—知识”一体化资源系统。该资源体系的建设为国家基因组科学数据的汇交共享、安全管理和挖掘利用提供了重要支撑。

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